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LicenceMasterPhysique-ChimieAvancé

Chimiometrie, chapitre 2/2 : les méthodes supervisées

  • Durée : 6 semaines
  • Effort : 7 heures/semaine
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Ce que vous allez apprendre

À la fin de ce cours, vous serez capable de :

  • appliquer le savoir-faire nécessaire pour traiter vos propres données.

Description

Peut-on estimer la composition chimique d'un échantillon en quelques secondes et sans le toucher ? Identifier son origine ? Oui ! C'est possible, en réalisant l'acquisition d'un spectre de l'échantillon et son traitement avec des outils de chimiométrie.

Ce cours est destiné à vous rendre autonome en chimiométrie. Mais le contenu est dense! C'est pourquoi le cours a été divisé en deux chapitres. Le présent chapitre est le deuxième. Il porte sur les méthodes supervisées et la validation de méthodes analytiques. Le teaser ci-dessus donne plus de détails sur le contenu. 

Ce cours est orienté vers les applications de spectrométrie proche infrarouge, les plus répandues. Toutefois, la chimiométrie est ouverte à d'autres domaines spectraux : moyen infrarouge, ultraviolet, visible, fluorescence ou Raman, ainsi qu'à bien d'autres applications non spectrales. Donc pourquoi pas dans votre domaine ?

Vous appliquerez vos connaissances en réalisant nos exercices d'application grâce au logiciel ChemFlow, gratuit et accessible via un simple navigateur internet depuis un ordinateur ou un smartphone. ChemFlow a été concu pour être aussi convivial et intuitif que possible. Ainsi, il ne nécessite aucune connaissance en programmation.

Bienvenue dans le monde fascinant de la chimiométrie.

Format

La durée totale de ce chapitre est de 8 semaines: une semaine d'introduction suivie de 7 semaines de cours.

Vous découvrirez deux méthodes de chimiométrie par semaine.
Le cours est proposé sous la forme de vidéos, repris dans un fichier pdf détaillé.
Pour chacune des méthodes présentées vous pourrez :
- tester vos connaissances avec un quiz ;
- les mettre en application avec un exercice en utilisant ChemFlow ou votre propre outil de chimiométrie .

Prérequis

être francophone : le cours est en Français, toutefois le logiciel ChemFlow est accessible en Français et en Anglais

niveau Bac+2 en sciences ou déjà une expérience pratique en spectroscopie ou chimiométrie

Ce cours s'adresse aux personnes pour lesquelles les mots « spectroscopie », « chimiométrie » ou « analyse de données multivariées » sont déjà connus et suscitent un intérêt; qu'elles soient :
- étudiants, pour une remise à niveau avant leur entrée en master ou en thèse impliquant la chimiométrie;
- étudiants en mathématiques intéressés par des applications pratiques à l'algèbre matricielle;
- stagiaires, niveau master/ingénieur, ou étudiants en thèse, ayant besoin d'utiliser ponctuellement des outils de chimiométrie;
- techniciens utilisateurs de spectromètres, souhaitant mieux comprendre les traitements de leurs données;
- ingénieurs ou chercheurs développant des méthodes rapides d'analyse, au laboratoire comme sur le terrain.

Evaluation et Certification

L'évaluation se fera par des quiz à l'issue de chaque grain (30% de la note finale) et par un exercice de mise en application de plusieurs méthodes évoquées dans le cours (70% de la note finale).

Plan de cours

    • Présentation du mooc
      Prise en main de la plateforme FUN
      Découverte du logiciel ChemFlow
      Introduction à la chimiométrie avec quelques définitions
      Statistiques simples
    • Prétraitements (1/2) - Régression linéaire
    • PLSR-Régression aux moindres carrés partiels (1/2)
      PLSR-Régression aux moindres carrés partiels (2/2)
    • Prétraitements (2/2)
      Bonnes pratiques de modélisation
    • Discrimination (1/2)
      Discrimination (2/2)
    • Sélection de variables (1/2)
      Sélection de variables (2/2)
    • Robustesse des modèles
      Analyse de variance, ASCA
    • Robustesse des modèles
      Validation de méthodes (1/2)
      Validation de méthodes (2/2)

Équipe pédagogique

DOMINIQUE BERTRAND

Ancien directeur de recherche à l'INRA, actuellement à la retraite.

JULIEN BOCCARD

Collaborateur scientifique au sein du laboratoire des Sciences Analytiques de l’Université de Genève.

JEAN-CLAUDE BOULET

Ingénieur de recherche à l'INRA de Montpellier, UMR1083 Sciences Pour l'Oenologie.

MAX FEINBERG

Ancien directeur de recherche à l’INRA à la retraite. Max Feinberg fut un initiateur de la chimiométrie en France à la fin des années 70.

FABIEN GOGE

Ingénieur à IRSTEA de Montpellier, à l'UMR ITAP.

MOHAMED HANAFI

Chercheur en statistique appliquée à ONIRIS Nantes.

BENOÎT JAILLAIS

Ingénieur de recherche à l’INRA de Nantes, Unité Sensométrie Chimiométrie.

ANNE JAULIN

Ingénieur d'études à l'INRA de Versailles, UMR1402 Ecosys, pôle Ecotoxicologie.

ERIC LATRILLE

Ingénieur de recherche à l'INRA au Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement à Narbonne.

CHRISTOPHE LEBEGUE

Responsable formation SupAgro INRA à Montpellier. Christophe Lebègue est spécialiste en ingénierie de formation et pédagogie.

SÉBASTIEN PREYS

Docteur en chimiométrie et ingénieur agroalimentaire.

CHRISTELLE REYNES

Ingénieur agronome et maître de conférences en biostatistiques à l'Université de Montpellier, rattachée à l'Institut de Génomique Fonctionnelle.

JEAN-MICHEL ROGER

Ingénieur IPEF à IRSTEA de Montpellier, UMR ITAP. Jean-Michel Roger est spécialiste en robustesse des étalonnages.

VIRGINIE ROSSARD

Assistant Ingénieur à l'INRA au Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement à Narbonne.

SERGE RUDAZ

Docteur en pharmacie. Serge Rudaz développe de nouvelles stratégies analytiques pour les sciences pharmaceutiques.

DOUGLAS RUTLEDGE

Professeur de Chimie Analytique à AgroParisTech. Douglas Rutledge enseigne la spectroscopie et la chimiométrie.

ROBERT SABATIER

Professeur de Statistique à l'Université Montpellier.

CÉCILE TREDANIEL

Ingénieur pédagogique à l'INRA de Montpellier. Cécile Trédaniel est spécialisée dans la coordination de projets coopératifs.

MYRTILLE VIVIEN

Maître de conférences en Statistique à l'Université de Montpellier.

Établissements

Agreenium

Partenaires

Ce cours a été financé par :

2015-2016: une aide de l'Agence Nationale de la Recherche, programme "Investissement d'avenir", référence ANR-10-LABX-001-01 Labex Agro, coordonnée par Agropolis Fondation, ayant permis la construction et la première édition du cours.

2017-2018: une aide de l'INRA, coordonnée par la Formation Permanente, ayant permis les deuxième et troisième éditions.

En savoir plus

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